青岛高阳国际物流有限公司总部设在青岛，分别成立了天津分公司、连云港分公司、黄岛办事处、临沂分公司和深圳分公司。

在青岛总部分别下设财务部、人力资源部、项目部、市场部、销售部和操作部。销售部又分为销售一部和销售二部。

其中，项目部的主要职能是提供特种柜、散货和滚装船的服务，以及承包大型工程和工厂搬迁等业务；市场部的主要职能是协调与船公司的关系，为公司的销售人员提供船公司信息服务；销售部和操作部的主要职能是为客户提供订舱、报关、报验、仓储、陆运等一系列的服务。